L’UPVD est une université pluridisciplinaire favorisant l’égalité des chances, avec un fort ancrage territorial en Occitanie Pyrénées-Méditerranée : 4 sites à Perpignan et 4 autres dans les Pyrénées-Orientales (Canet, Tautavel et Font-Romeu, Port-Vendres), 3 sites dans l’Aude (2 à Narbonne et 1 à Carcassonne) et deux sites délocalisés à Paris et au Maroc.
Comptant environ 9500 étudiants dont 350 doctorants, l’UPVD emploie près de 450 personnels enseignants-chercheurs et enseignants, 400 personnels administratifs et techniques et plus de 600 vacataires. L’université compte 5 facultés et 3 instituts. Forte de ses 17 laboratoires dont beaucoup sont liés à des instituts nationaux (ex. CNRS), de ses deux fédérations de recherche, de ses écoles doctorales, l’UPVD est en pointe sur les enjeux sociétaux actuels, notamment la transition écologique, la biodiversité et l’adaptation des plantes aux changements climatiques. Ses axes de recherche concernent plus généralement le monde du vivant, les sciences et techniques, les lettres et sciences humaines mais également le droit, les sciences économiques et le management. L’UPVD compte également une Fondation Universitaire.
Le projet ORIGAMIS ayant pour objet : "Origine des supergènes et traits magiques des orchidées du genre Ophrys a été sélectionné par l'ANR dans le cadre de l'appel à projets intitulé CE02.
Notre projet de recherche ANR PRC ‘ORIGAMIS’, s’intéresse à l’étude des processus de spéciation écologique et de radiations évolutives adaptatives, avec pour modèle biologique les orchidées mimétiques du genre Ophrys.
Dans ce cadre, nous recherchons une personne dynamique, motivée et autonome étant capable de mener à bien les missions suivantes :
- Co-pilotage d’un projet de recherche scientifique
- Planification, acquisition et production, analyse et interprétation, organisation des données pour archivage.
- Valorisation des résultats par la rédaction et la publication d’articles scientifiques ainsi que des activités de communication
-Contribution à la formation d’étudiant.s.es et jeunes chercheu.rs.ses
ACTIVITES
- Préparation et organisation des missions de terrain, gestion des échantillons et des données,
- Réalisation de l’échantillonnage en milieu naturel (repérage et optimisation du design expérimental, identification des plantes, géolocalisation et marquage des individus, prise de photographies calibrées, mesures morphométriques, acquisition de nuages de points pour la réalisation de modèles 3D, prélèvement de tissus en vue des analyses génétiques, transcriptomiques et métabolomiques, évaluation de traits reflétant la fitness des individus,
- Analyse, traitement et interprétation des données phénotypiques (morphologie/modèles 3D, coloration, odeur, fitness, traits fonctionnels, profils métabolomiques) et génétiques (SNPs, séquences et matrices de niveaux d’expression),
- Co-conception, co-rédaction et publication d’articles scientifiques,
- Assurer une veille bibliographique, technique et méthodologique,
- Participation à l’encadrement d’étudiant.s.es et jeunes chercheu.rs.ses.
ENVIRONNEMENT & CONTEXTE DE TRAVAIL
Encadrement
La personne recrutée intègrera le projet ORIGAMIS, financé par une ANR PRC (2026-2029) porté par un enseignant-chercheur (Maître de Conférences HDR UPVD) également animateur d’une jeune équipe GENOMIcs, genetic eXchanges, adaptation & evolution (Geno’Mix) de l’UMR CNRS/UPVD 5096 Laboratoire Génome & Développement des Plantes.
Elle pourra ainsi bénéficier du soutien technique et logistique d’une Technicienne UPVD, de trois autres enseignant-chercheurs et d’un Chargé de Recherche CNRS.
En outre, nous bénéficierons de l’appui des plateformes locales de séquençage BioEnvironnement et de métabolomique (plateau MSXM de la plateforme Bio2mar) La contribution à l’encadrement d’étudiant.s.es de Master est souhaitée.
Nous veillerons à ce que la personne recrutée ait également la possibilité d’être force de proposition et pourquoi pas, puisse développer une recherche plus personnelle en cohérence avec le projet et son développement de carrière.
En retour, et si nécessaire nous pouvons proposer à la personne recrutée de parfaire sa formation en analyses bioinformatiques orientées vers la phénomique.
Elle travaillerait aussi en étroite collaboration avec l’équipe partenaire et notamment Yann Bourgeois (DIADE, IRD, Montpellier) et un post-doc spécifiquement recruté pour travailler sur les aspects génomiques en lien avec le projet.
La personne recrutée intègrerait aussi un consortium dynamique intéressé par le modèle Ophrys ainsi que les interactions plantes-pollinisateurs dans un contexte de changement global.
Conduite de projet
Le contrat est prévu pour une durée initiale de 18 mois (à compter du premier trimestre 2026).
Le printemps 2026 sera dédié à la préparation de la première campagne de terrain (mai-juin) et nécessitera de prévoir et acquérir le matériel et les consommables, obtenir les autorisations de collectes en espace naturel protégés et/ou chez des propriétaires privés. L’été et l’automne seront dédiés à l’analyse, au traitement, à l’interprétation des données et à la préparation des manuscrits.
Contraintes particulières
Durant la période d’échantillonnage en milieu naturel (avril à juillet), les horaires et jours de travail sont susceptibles de devoir être adaptés en fonction des conditions météorologiques et/ou des pratiques agro-pastorales sur les sites d’étude. En particulier, il sera parfois nécessaire de commencer à travailler tôt le matin, occasionnellement les dimanches et jours fériés. Une partie du terrain se déroulera dans les Grands Causses et à l’étranger (Espagne) à environ 6h de route de la résidence administrative (nécessitant de dormir sur place sur une durée allant jusqu’à une semaine). Permis B, carte d’identité et/ou passeport en cours de validité sont donc indispensables. Carte vitale européenne en cours de validité recommandée.
Docteur en biologie de l'évolution & écologie
Niveau DOCTORAT avec expérience dans des missions similaires indispensable
CDD de 18 mois - Prise de poste : 01 avril 2026
Fournir : CV, lettre de motivation et diplôme - Date de fin de publication : 8 mars 2026
Type de contrat de travail proposé :
contrat post doctoral (loi LPR) ou contrat de projet IGR (selon ancienneté du candidat retenu)
COMPETENCES
Connaissances :
Solide expertise scientifique biologie de l’évolution et en écologie (niveau doctorat indispensable) s’accompagnant d’une expérience en préparation et réalisation des missions d’échantillonnage en milieu naturel (une activité de recherche sur des modèles plantes serait un plus).
Une très bonne maîtrise du phénotypage des plantes (en milieu naturel), du langage de programmation R (et/ou Python) apparaissent comme des prérequis indispensables.
Des connaissances, ou un intérêt à développer une expertise dans l’utilisation d’approches de type computer vision basées sur des algorithmes de type Machine Learning voire Deep Learning pour l’étude de la biodiversité sont souhaitées.
Savoir-faire :
Techniques d’échantillonnage en milieu naturel, Code informatique (R, Shell Unix, Python), Bibliographie, Rédaction et communication scientifique (français/anglais).
Une certaine maîtrise de l’espagnol serait appréciée. Des compétences en matière de géo morphométrie 2D et 3D, de photogrammétrie, de méthodes supervisées et non supervisées pour traiter et analyser les données produites (images 2D et modèles 3D) seraient un plus.
Savoir être :
autonome, fiable, organisé.e, rigoureu.x.se,
faire preuve de sens critique, avoir de l’initiative, avoir l’esprit d’équipe,
présenter une aptitude certaine au dialogue avec des interlocuteurs scientifiques (dont nos partenaires IRD sur le projet),
gestionnaires des espaces naturels, acteurs locaux (élus, agriculteurs) ainsi que le grand public.